Iki 2010 metų Mokslo ir enciklopedijų leidybos institutas rinko Tarybą
Pirmininkas
Lietuvos MA tikrasis narys, Lietuvių katalikų MA akademikas prof. habil. dr. Zigmas ZINKEVIČIUS
Sekretorius
Lietuvos MA tikrasis narys, Lietuvių katalikų MA akademikas prof. habil. dr. Bronius GRIGELIONIS
Nariai
prof. habil. dr. Antanas ANDRIJAUSKAS
prof. habil. dr. Juozas ANTANAVIČIUS
Lietuvių katalikų MA prezidentas vysk. doc. dr. Jonas BORUTA SJ
Lietuvos MA tikrasis narys prof. habil. dr. Antanas BURAČAS
Stanislovas Gediminas ILGŪNAS
Rimantas KARECKAS (Instituto direktorius)
dr. Stanislava Nerutė KLIGIENĖ
prof. dr. Alvydas PUMPUTIS
Lietuvos MA prezidentas prof. habil. dr. Zenonas Rokus RUDZIKAS
Lietuvos MA narys ekspertas, Lietuvių katalikų MA akademikas prof. habil. dr. Antanas TYLA
Lietuvos MA narys korespondentas prof. habil. dr. Edmundas Kazimieras ZAVADSKAS
DIREKCIJA
Direktorius
Rimantas KARECKAS
Direktoriaus pavaduotojas redakciniams darbams
Antanas RAČIS
Direktoriaus pavaduotoja ekonomikai
Aldona STANELIENĖ